建筑工程学院是在原有“两院（汽车与建筑工程学院、生态农业学院）”、“两个专业（含四个专业方向）”基础上，按照专业特色分离归并而成立的学院重点建设院系之一。

学院设有综合办、学生工作办公室、教学管理办公室三个职能部门及园林工程技术、建筑施工技术、工程预决算等三个专业教研室，建有建筑实训中心。